注册公司的类型有很多种，很多类型的公司不能够以工厂的形式作为经营方式，只有一些加工公司或者是其他的一些特殊行业才允许以工厂的形式作为经营的模式，工厂的形式可以是公司也可以是个体户，工厂可以是一些贸易加工公司注册，也可以是个人注册的，有很多的农业加工的工厂都是以个体户的形式存在，所以工厂不一定要按照公司的注册流程进行。
二、办理证件方面的区别
如果是注册公司成立的工厂或者是个体户经营成立的工厂一定要办理环境影响评价，还有其他的一些特殊审批，注册公司的行业非常多，注册公司一般的行业都不用办理环境影响评价，每一个行业都有特殊的入门许可证，所以注册公司很工厂需要办理的证件也是不一样的。
三、公司的注册地址方面的区别
注册公司和工厂都一定要有注册地址，但是注册工厂一定要有正规正式存在的地址，因为工厂需要办理环评，所以注册的地址和营业的地址一定要真实，注册公司则不一样，注册公司可以虚拟挂靠的地址，现在创业很难，大部分的人为了节省成本都会选择注册公司地址挂靠，而且现在注册公司还可以一址多照，一个地址在满足一址多照的情况下是可以注册多个公司的，注册公司的经营地址还可以是多个。
四、税务方面的区别
注册公司的小规模纳税人增值税是3%按照开的发票额来算，公司一般纳税人的税率是16%，增值税的算法是销项税减去进项税，还有其他的税种，工厂的增值税是按照销售收入的16%和6%来征收一般纳税人和小规模加工纳税人，其他的税收率和公司的税收率都有一定的区别。
公司和工厂的区别主要就是这四个方面，可以说两者之间的区别还是很大的，如果想要开厂，则需要想清楚是注册公司还是个体户，如果是大型工厂，建议注册公司，因为个体户收入高的税率是非常高的。
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