如果要分析它们有何不同，首先要从它们的结构入手，众所周知，PA6是由己内酰胺开环聚合而成，而尼龙PA66则是由己二胺和己二酸的缩合聚合物获得。PA6的分子式与PA66相同，但结构式不一样。
而正是因为这一点的差异，才导致了其分子间氢键作用力不同等不同性质的差异。PA66的氢键数量比PA6的氢键多，PA66的分子间作用力比PA6强，所以PA66在热学性质上比PA6好(因此加工温度更高)，PA66的刚性比PA6好，PA6的韧性比PA66好，PA6的吸水速度比PA66快，PA6与PA66的性质差异主要是由上述氢键因素引起的。
物理性能
PA6和PA66都是半透明或不透明的乳白色结晶聚合物。但生产原料差别较大：PA6原料为己内酰胺，由己内酰胺开环聚合而成；原料的制造主要是石油苯，有些厂家受制于石油苯供应不足，所以用到了数量极少的加氢苯。PA66则是由己二胺与己二酸缩聚制得。
PA6熔点较PA66低，工艺温度区间较宽。比PA66具有更好的抗冲击性和抗溶解性，但也具有更强的吸湿性。由于塑件的许多质量特性都要受到吸湿性的影响，因此在使用过程中要多加留意。但PA66分子排列呈对称分布，所有旗基和氨基均可形成氢键，加之纺丝过程中其动态结晶能力比PA6高出约20倍，PA66工业结裂隙强度因此达到9.7g/d，而PA6工业结强度在同等条件下仅为9.0g/d左右。
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